Так вот к чему этот саботаж уроков? 

а можно японский оригинал этой фразы? а то странно получается, харухи тащит кёна в темное место для разговора один на один, а потом там появляется какой-то парень. может, лучше "бедного меня" или как-нибудь так?

2. Что не ясно? Харухи считает, что перевод посреди учебного года - уже признак загадочности. "Чего тебе" непонятно? Хм, ну, поправлю на "Ну, что непонятно?"

{ля-ля тополя о временных осях}
Асахина взволнованно затрясла головой из стороны в сторону, и ее волосы закачались в такт движениям.
Потом она смущенно улыбнулась и низко-низко поклонилась.
- Прошу прощения за нерасторопность, приятно познакомиться.
- Эй, ты так говоришь… <— Кен вдруг скатывается до грубости
- И еще, зови меня, пожалуйста «Микуру-тян»! – она опять улыбнулась.
Ах! У меня голова кружится, как вспомню, какая же она милая! <— "вспомню?" рассказ вроде велся в настоящем времени,
Однажды Харухи произошел такой разговор. <— переход нужно помягче сделать или разделить на абзацы
- Знаешь, что нам теперь нужно?
{ля-ля про новичка}

2. смысл последнего предложения не ясен

Учебный год два месяца назад начался! Если в такое время, посреди учебы к нам кто-нибудь переведется, то он, думаю, будет вполне загадочным. Чего тебе?

Буду вычитывать дальше, если что - отпишусь)

Есть замечательная статейка. Хотя речь в ней идет об ошибках перевода с английского, полезна она будет для любого переводчика. Вот здесь: http://www.bakanov.org/default.php?rubrica=80&id=36

PS: если хочешь обсудить отмененные мной правки - всегда пожалуйста в форуме. Предлагай свой вариант, если твоя правка действительно покажется мне лучше, я САМ поправлю текст. Для меня мой вариант не догма, особенно в первом томе. Редактура в любом случае приветствуется.

Будет оставлено хоть что-нибудь из измененного мной, или оно все не существенно?

С торжественным видом Харухи вытащила какую-то черную деталь костюма. Не может быть! Как только она опустошила четвертое измерение пакета и полный комплект был собран,

Кстати говоря, не с "торжественным видом", а с торжествующим.
А мне эта фраза кажется диковатой. Когда это читаешь, представляется какой-то мега-супер-дупер-волшебный четырехмерный пакет - а ведь речь-то идет о совершенно обыденной ситуации, просто пакет такой огромный… Здесь, мне кажется, должно быть что-то вроде сравнения, а не констатация факта. Может, все-таки перефразировать, хоть чуть-чуть? Ну, хотя бы так: "Как только она опустошила пакет, который, казалось, имел четыре измерения, и полный комплект был собран…"

"лететь поступью" мне все-таки категорически не нравится, но настаивать не стану - как говорится, "хозяин - барин" ^^

2. Во-первых, повтор "подняла" - "подняла", во-вторых, "она" после запятой, с первого взгляда, будто бы относится к Харухи. Можно переделать, например, так (не самый лучший вариант, но все же): "К этому моменту Харухи уже порядком нашумела [хочется сказать "навела шухер" ^_^], но эта девушка даже ни разу не подняла голову. (…) Да эта десятиклассница и сама страннее некуда".
Поправил

3. Добыча в виде - представляется, что у нее в руках было нечто, похожее на грудь Асахины. Предлагаю проще: "Захватила свою добычу - грудь Асахины".
Поправил

4. Четвертое измерение пакета? Как это понимать? Я что-то пропустила?
Так в тексте, и в английском варианте, кстати, так же. По- моему, все понятно - бездонный пакет да и все, я не задумывался и восприятие этой фразы проблем у меня не вызвало.

К тому моменту Харухи уже подняла порядочную суматоху, но она даже ни разу не подняла голову

А! Можно еще так: "К этому моменту Харухи уже наделала шуму, но эта девушка даже ни разу не подняла голову"…

энергичной поступью летя вперед

Я бы сказала, что "поступью" не летят, а идут. Можно сказать просто "энергично продвигаясь вперед и сметая на своем пути школьников".

К тому моменту Харухи уже подняла порядочную суматоху, но она даже ни разу не подняла голову

Во-первых, повтор "подняла" - "подняла", во-вторых, "она" после запятой, с первого взгляда, будто бы относится к Харухи. Можно переделать, например, так (не самый лучший вариант, но все же): "К этому моменту Харухи уже порядком нашумела [хочется сказать "навела шухер" ^_^], но эта девушка даже ни разу не подняла голову. (…) Да эта десятиклассница и сама страннее некуда".

Захватила свою добычу в виде груди Асахины.

Добыча в виде - представляется, что у нее в руках было нечто, похожее на грудь Асахины. Предлагаю проще: "Захватила свою добычу - грудь Асахины".

Как только она опустошила четвертое измерение пакета и полный комплект был собран

Четвертое измерение пакета? Как это понимать? Я что-то пропустила?

=_= по всему тексту

Не, не по всему, просто пропустил.

- Ну что за…!

=_= по всему тексту

криво. Голос был такой, что через три секунды уже ничего не помнишь, что она говорила.

Тут не только "что она говорила", но и сам голос, на я исправил, по другому, правда.

Вот, значит, чем…

Разницы, в общем, не вижу.

Вон, сколько их у вас.

Думаю, мой вариант больше по стилистике подходит. Оставил как есть.

менно совершили, а не только собирались?

Да.

Может, появилось плохое предчувствие?

Оставил как есть. Это внутренняя речь Кёна, судя по всему, а слово "появилось" - скорее для "описательного" стиля.

…пожёвывая… ^_^

Ну, не знаю, тут и я сомневаюсь. "Едя бэнто", что ли. Я думаю, сам терпин "бэнто" надо оставить, т к. он часто встречается.
Кстати, только заметил у себя разные транскрипции: "бэнто" и "Окабе". Надо будет потом править…

Эй… и ты тоже меня так зовешь, да?

Имеется в виду, что она тоже назвала его Кёном. Уточнил, хотя в оригинале и нет этого уточнения, там именно "так называешь"

в 10-И переводят нового ученика.

Судя по всему, 9 потоков, если я что-то не напутал.

Голос был такой, будто услышав его, через три секунды уже ничего и в памяти не останется.

криво. Голос был такой, что через три секунды уже ничего не помнишь, что она говорила.

вылетела из класса со скоростью, увидев которую я понял, почему ее так настойчиво приглашала к себе секция легкой атлетики.

вылетела из класса с такой скоростью, что я понял…

вдруг дверь распахнулась настежь, как если бы ее выбили ногой.

вдруг дверь распахнулась, будто её выбили ногой.

Пока поймала, времени немало прошло!

Пока поймала(ловила), столько времени прошло!

Значит, вот чем ты занимаешься на переменах.

Вот, значит, чем…

- Вот ведь бесит, а!

Не по-русски. Вот ведь, а!

- Так что значит? Ты что, притащила сюда это…

Это что, ты притащила сюда…
это – как будто указывает на Асахину в среднем роде.

Некоторое время задержав на ней взгляд

задержав на ней взгляд на некоторое время

рядовой состав в этот день был распущен

…на сегодня был распущен

Наверное, это необходимо в этой временнОй плоскости

есть же символ ударения
временн́ой

с серьезным видом исправно появилась, и пришвартовалась к складному стулу.

не надо запятой

- В общем, я за добычей! - с глазами браконьера, собирающегося поохотиться в заповеднике, объявила она.

- обявила она с глазами…

поляроид

ы. Полароид.

На расставленных в ней столах находились мониторы и идолами возвышались системные блоки.

…стояли мониторы…

Вон, у вас их сколько!

Вон, сколько их у вас.

Я не при чем!

Я ни при чём!

с отрытыми ртами

и где же они их отрыли?

все вы сговорились и совершили над этой девочкой групповое изнасилование!

именно совершили, а не только собирались?

и выметайтесь…!

!..
…! – так не пишут
и так по всему тексту

- Уууууу……

достаточно одного многоточия

распростерлась по столу Асахина.

на столе

пока я, жуя бэнто, в обеденный перерыв без толку щелкал мышкой.

…пожёвывая… ^_^

Мне все равно, но она на уроки-то ходит?

Мне конечно всё равно, но на уроки-то она ходит?

- Это секрет! - сказала Харухи с загадочно-зловещей улыбкой. У меня плохое предчувствие.

Может, появилось плохое предчувствие?

Я пробралась в помещение типографии и напечатала двести штук!

Я пробралась в типографию и…

сведения о всем необыкновенном

обо всём

- Кяя…!!! - Нееет! - Я сама…!

снова многоточия не там
- Кяя!!! - Нееет! - Я сама!..

Эй… и ты тоже меня так зовешь, да?

не понял, к чему эта фраза

в 10-И переводят нового ученика.

10И? Нехило. Сколько же у них там потоков?

задочный?

Фрейд бы долго смеялся.

Какой бы упорной не была Харухи

ни была

- Смешение времён. Однозначно: "как прибежали учителя и потребовали прекратить" или "стали требовать прекратить". -
Я думаю, все в порядке - это экспрессивная разговорная речь.

- Та же проблема что и в первом чаптере. "Жевать бэнто" - несколько неправильное выражение. -
Да нормальное выражение! Говорим же мы "едим обед"! Само слово "бэнто" употреблено, чтобы подчеркнуть, что обед Кён носит с собой. В оригинале так и значиться - жевать бэнто. Вполне нормально.

quoted text все пространство было заставлено там и тут

Я не уверен, но мне кажется здесь противоречие. "Тут и там" это означает "местами". Получается, что "всё пространство было местами заставлено". Если именно это и имелось ввиду, то всё ОК. Иначе же ошибка.

quoted text Не успела я и половины пачки раздать, как прибежали учителя и требуют прекратить!

Смешение времён. Однозначно: "как прибежали учителя и потребовали прекратить" или "стали требовать прекратить".

quoted text пока я, жуя бэнто, в обеденный перерыв без толку щелкал мышкой.

Та же проблема что и в первом чаптере. "Жевать бэнто" - несколько неправильное выражение.